科學儀器設備的研制與創新直接關系國計民生，特別是在高精尖，或量大面廣且具有市場效益的儀器設備領域，以及必須替代進口的社會急需領域。然而恰恰是在這些重要領域，國產科學儀器自主創新難的問題尤為突出。
完整的科學儀器創新過程應該是一個“用—造—用—造”不斷重復的過程，這也是科學儀器的本質特征。但在現有的科研及產業環境下，這樣的循環體系還很難建立起來。
在國外，科學儀器制造企業通常會“依附”于大學、科研機構，通過搜羅科學家的奇思妙想和他們的一些雖不成熟卻具有應用價值的半成品，加以創制、完善，以充實、更新自己的產品體系，以便穩居科學研究領域的技術設備優勢地位;或者敏銳把握市場趨勢性需求并反饋給科學家和技術人員，鼓勵他們開發能夠直接解決實際需求的產品。無論哪一種發展模式，從“用”到“造”的不斷反復的過程是不可或缺的。因此，大學、科研機構自然地成為科學儀器創制的源頭，企業則負責制造環節創新與質量控制。
科學儀器主要是由科學家創造出來的，它的首要目標是滿足科研需求、引領新的科學工作。但我國的情況是“造用分開”，國家投錢，科研單位研發、企業制造，科研與制造相互割裂，而不是互為引領。
事實上，在部分高校，自己掏錢、憑著興趣鼓搗科研儀器的人大有人在。這些老師往往有較充裕的業余時間，有學生幫忙，而且他的工作本身和儀器研發往往有著緊密的聯系。但這種純興趣的活動和商業的聯系非常小，很多情況下走不到成果轉化的階段。
即使出了成果，不少老師傾向于把成果一賣了之，這樣雖然避免了轉化期的種種瓜葛，但這種半成熟的成果往往因此失去了生命力。
科學儀器市場需求小，但利潤較為可觀，可能賣一臺儀器的利潤就夠生存幾年。這種模式相對比較容易成功，卻要承擔創業的巨大風險，這讓很多老師倒在成功的途中。
據不完全統計，“十一五”以來我國啟動的部分科學儀器自主研制相關重大項目或專項國撥投入超過13億元。高端儀器是科學儀器行業中領軍的部分，沒有這樣的大工程、大項目存在，就不會有整個儀器行業金字塔的底部。市場的土壤，或者說市場性需求任何國家都有，但如果沒有大的科學儀器工程、項目做支撐，這個市場將不會長久發展。美國、歐洲的科學儀器行業非常發達，背后都有國家科學計劃的支持。
科學儀器不是商業化能夠完全操縱的，科學意義和市場有時沒有太大關系。同時，國家需要把它上升到準軍工行業的高度，繼續加大對科學儀器重大科研項目的支撐，并進一步鼓勵企業參與創新，因為從“中國制造”到“中國創造”的轉變，企業依然是核心力量。