有機化學是研究有機物的組成、結構與性能、合成和應用以及與此相關的理論問題的學科，是應用化學、化學工程與工藝、材料科學與工程、環境工程等專業的一門專業基礎課程，在上述專業學生的知識結構中，起著承前啟后的重要作用，扮演科學素質教育和專業基礎教育雙重角色，可以幫助學生應用有機化學基本理論和方法理解和解決有機化工、石油化工、高分子化工、高分子材料、復合材料、精細化工、天然產物應用、大氣污染、水污染等領域中的一些理論和實際問題，是理論與生產實際之間的橋梁。通過本課程的學習，使學生掌握有機化學的基本理論，掌握各類有機化合物的結構與性能、合成方法以及它們之間相互聯系的規律和理論，理解有機物的結構與性質之間的關系，一般了解有機化學領域重大的科學技術新成就，培養學生具有初步的分析和解決有機化學與有機化工問題的能力，并為高分子化學、精細化工、環境化學等后續課程打下深厚基礎。
1988年，礦井通風專業開設了有機化學課程，選用汪小蘭主編的《有機化學》為基本教材。葛嶺梅副教授主講；1989年，化學師范專業（大專）開設了有機化學課程，選用了由東北師范大學等五所師范院校合編的《有機化學》為基本教材，駱志勤福教授、李侃社講師主講。1994年，開辦化學工程與工藝專業、1999年開辦材料科學與工程和環境工程專業、2002年開辦應用化學專業，有機化學是上述四個專業的主干基礎課程，并按照工科、理科培養目標的不同分別選擇高宏斌主編、高教版《有機化學》、南京大學胡宏紋院士主編、高教版《有機化學》為基本教材，分別由蔡會武、李侃社、賀擁軍等主講。
為了進一步促進有機化學的教學工作，提高教學質量，就有機化學教學中的若干問題進行研究與討論，形成了“《有機化學》重點課程建設”、“有機化學精品課程的建設與實踐”、“有機化學公共課多媒體課件的制作”等教學研究課題，通過學校立項，把有機化學的教學研究成為一個常抓不懈的工作。有機化學課程于2003年被列為西安科技大學重點課程進行建設，經兩年多的建設，使我校有機化學的教學質量有了明顯的提高。課程被評為2005年度陜西省省級精品課程。
根據我校培養應用型創新人才的定位和不同專業的培養目標的差異，2005年對教學文件進行了系統修訂，按照“一體化設計、分層次教學”，化學與應用化學類、化工與材料類和礦業及環境安全類專業分別制定了教學大綱，強調教學目標和教學重點的差異，2004、2005級學生執行新大綱。1999年，開始了有機化學實驗教學改革。我們結合自身的科研工作和其它資料，根據學生的實際情況，有針對性地對部分實驗讓學生自己設計實驗方案的嘗試，改變千篇一律的照單抓藥式的實驗方式。2002年開始進行化學實驗教學內容體系的優化整合，從綜合性、設計性理念出發，開設了有機合成實驗，融性質試驗于合成實驗之中，給學生以內容或方法上的綜合練習，力圖培養學生的科研素養和創新精神。